La microscopia elettronica è parte integrante e fondamentale nella diagnostica delle malattie infettive. Il microscopio elettronico è stato a lungo utilizzato nella scoperta e descrizione delle malattie infettive, in particolare nei casi in cui gli agenti sono sconosciuti o insospettabili. In particolare la Microscopia Elettronica è stata fondamentale nell’identificazione del primo focolaio del virus Ebola in Zaire nel 1976. Presso l’INMI Lazzaro Spallanzani è presente un centro di diagnostica ultrastrutturale d’eccellenza, sia per quel che riguarda la presenza nel laboratorio di apparecchiature d’avanguardia che coprono le più importanti metodologie ultrastrutturali sia per quel che riguarda la presenza di personale altamente qualificato. Oltre all’ uso diagnostico, il centro si occupa in particolare di ricerca. L’apporto della microscopia elettronica è infatti importantissimo nel chiarire la funzione dei vari componenti virali e nello studio dell’interazione ospite-parassita, utili ai
fine di trovare una terapia farmacologica efficace.